玩家滚动鼠标滚轮可以切换手雷和燃烧瓶，按下滚轮即可扔手雷或者燃烧瓶。按住鼠标滑轮键，按的时间越长，并保持适当的角度，扔出去的距离就越远。

对付不同距离的敌人的时候要选择不同的出手时机，越近的敌人就要在手里多捏一会，越远的敌人则越要扔得早一些，尽量确保手雷飞到敌人身边时刚好爆炸。

《孤岛惊魂6》是一款动作冒险第一人称射击游戏，并沿用前作的临时枪支、载具和雇用同仁系统，以及用作推翻残暴政权的“招募犬牙”系统。

《孤岛惊魂6》的故事发生在虚构的加勒比岛屿“雅拉”（Yara）上。该岛的灵感来自古巴，开发团队形容该作将会是“孤岛惊魂系列中迄今为止最大的开放世界”，并称岛屿“雅拉”为“仿佛时间遭到停止的热带天堂”。

“雅拉”由绰号“总统”（El Presidente）、独裁者安东·卡斯蒂约（Antón Castillo，由吉安卡罗·埃斯波西托饰演）完全掌控，他正引导儿子迭戈（Diego，由安东尼·冈萨雷兹饰演）成为其继承者，但后者并未确定自己未来是否会走上父亲的老路。